建筑采用坚固的石材搭盖，内设有安全设施，而且若发生什么毒气外泄等危险事件，还有一层以特殊合金制作的隔离外壁，能将核能等危险物质做最安全的隔离。
研究所一切的安全判定来自位于研究所中枢的电脑主机，它的人工智慧经过哥达‧戴里克改良后，操作速度比其他国家所使用的电脑都还要来得灵巧，功能相对地也提升许多，这也是他之所以会这么自负的原因。
为了防止他国间谍潜入这间研究所，窥知这里的秘密，哥达‧戴里克还曾经大改内部装潢。他将安全管理交由声纹和指纹辨识，最重要的关卡则还有全身电脑扫描的手续，相当地严密。
而且奈巴特研究所每一层的区域都大不相同，除了高阶层人员以外，一般研究人员只认识自己单位的人员，其他人员概不认识，因此即使只有楼上和楼下，可是却没有办法互相通讯，